1.招标不够规范，为合同管理埋下了隐患
随着“三制”改革的深入开展，机电工程建设市场已逐步规范，但由于施工合同的双方在利益上存在矛盾，表现在合同上，如某些机电工程在招标过程中,利用僧多粥少的心理对承包人提出一些苛刻条件,迫使承包人压级压价,给承包人增加额外负担，甚至直接压低中标价格,使承包人受到一定的经济损失。为顺利承包到工程，且迫于自身生存和发展的压力,大多数承包人面对不够公正的合同条款也只能委曲求全。同时，有的承包人为提高中标率，搞联合投标，甚至恶意串通，抬高中标价，造成不正当竞争，扰乱建设市场，造成施工力量强、管理水平高的承包人不能中标，项目不能顺利实施，机电工程建设质量得不到保证，给施工合同管理带来被动。
2.“阴阳合同”充斥市场。
“阴阳合同”是指发包人在有形建筑市场通过公开招标选择承包人，并按照招标文件及中标通知书要求，与中标承包人签订施工合同，俗称“阳合同”；在有形建筑市场以外，另行与承包人签订一份合同书或补充协议，该合同未经建设行政主管部门审查备案，但在实际施工活动中被双方认可，即所谓的“阴合同”。各种“阴阳合同”尽管表现形式各异，但归纳起来“阴合同”主要在以下几方面与“阳合同”存在明显差异：发包人利用自己在建设工程发包中的主导地位，将自身的一些风险转移到承包人身上。
3.机电工程承包人进场的机械设备短缺，或以次充好，以及在施工高峰时期将设备调到其它项目，造成施工进度滞后，施工质量低劣，给工程带来不必要的损失。
对策及预防措施：在施工主要设备进场并提交检测合格证书，经监理单位人员清点验收后，且其估算价值已达到第二次工程预付款金额后，方支付第二次工程预付款。为防止承包人在施工高峰时期将设备调走，可在招标文件专用技术条款中规定，承包人未经业主或监理单位批准，擅自在施工高峰时期将设备调走，影响机电工程施工进度和质量，承包人需支付一定数量的违约金，违约金金额的定取要足以引起承包人的重视。也可采取缓支付工程价款的惩罚性方式，但执行起来容易引起合同争端。
4.承包人文明施工、安全生产和环境保护投入不足。按合同规定，工程量清单中的单价和合价包括由承包人承担的直接费、间接费、其它费用、税金等全部费用和要获得的利润以及应由承包人承担的义务、责任和风险所发生的一切费用，承包人理应保证文明施工、安全生产和环境保护资金的投入，以利于机电安装工程设计进度和施工质量，保证良好的施工外部环境，维护和提升企业形象。但有的承包人目光短浅，舍不得“花小钱，办大事”，结果因小失大，导致施工场面混乱，造成环境破坏和安全事故，损害项目法人和其他人的财产和利益，影响施工进度和施工质量，给工程形象带来负面影响，损害企业自身形象。
可以说，机电工程企业合同管理是一个系统工程，需要各子系统、分系统共同配合。本文第一部分所提出来的问题，其中一个重要原因是部门之间的履约责任不明确、不沟通、不落实，造成失误。合同管理比其他管理更需要信息沟通和处理。
