Ruffell等人利用动物感染和试管脱囊技术评价了ClO2对隐孢子虫卵囊的Iowa变种的灭活效果，结果显示，在pH值为8.，要达到99%的灭活率。氧消毒臭氧作为一种新型消毒剂，已经在水处理领域中开始被广泛使用。高级氧化过程能够产生大量的高活性羟基自由基，能够将有机物氧化或碳化为水、二氧化碳和无机酸；除此之外，臭氧对水中的微生物（细菌、病毒和原生动物等）也有极好的消毒效果。冉治霖等利用荧光活体染色法研究了臭氧灭活水中隐孢子虫和贾第虫的灭活效能，并对机理进行了探讨，pH值为中性条件，投加初始浓度为3.mg/L的臭氧，反应时间7min，灭活率可达到99.9%；究其原因可能是高级氧化产生的羟基自由基可破坏的细胞结构、引起细胞膜通透性畸变、裂解，致使细胞器外泄，引起细胞凋亡。
