番茄茎基腐多在进入结果期时发病，仅危害茎基部。发病初期，茎基部皮层外部无明显病变，而后茎基部皮层逐渐变为淡褐色至黑褐色，绕茎部一圈，病部失水变干缩。病部以上叶片变黄，萎蔫。后期叶片变为黄褐色，枯死多残留在枝上不脱落。根部及根系不腐烂。
发病规律：该病系土传病害，病菌以菌丝体和菌核随病残体在土壤中存活和越冬。近年山东秋季定植后后7-10天至第一穗果开花结果期普遍发病。定植后露地番茄遇到阴雨天气，光照不足或温差大，植株生长衰弱易发病，秋延后番茄、秋冬番茄或越冬大棚番茄和长季节、反季栽培的番茄发病重。
主要原因：一是定植前土壤未消毒或消毒不彻底。大棚内土壤连茬种植茄果类致使病菌在土壤中积累，一旦出现发病条件立刻发病。二是越冬大棚番茄定植期过早，苗期低温过高，大水漫灌后，根系透气性降低，病菌侵入植株茎基部而发病。三是植株生长势弱，土传病害的病菌有了可乘之机。
防治方法：青枯立克60-100倍+大蒜油1000倍+沃丰素600倍+有机硅2000倍喷雾或灌根。连喷2-3次，每次间隔2-3天。
