PCR实验室是常用于医院、疾控中心、中心血站等地方，PCR实验室布局的合理性关乎到实验检测结果的准确性，所以它必须按照卫生部颁布的《linchuang基因扩增检验实验室基本设置标准》进行设置。在排风、废气处理、实验室内负压设置要具合理性。
标准PCR实验室设计原则：
（一）标准PCR实验室的工作区
（1）试剂准备区
设置有实验桌、柜子、冰箱、可移动紫外灯、与标本制备区连通的传递窗和椅子，在实验桌上可放置实验仪器设备（包括离心机、震荡器、移液器、离心管、废液缸和垃圾筒等）。
（2）标本制备区
设置有实验桌、冰箱、生物安全柜、可移动紫外灯、水槽和椅子，在实验桌上和生物安全柜内还放置有实验仪器设备（包括离心机、恒温金属浴、移液器、离心管、废液缸和垃圾筒等）。
（3）PCR扩增区
设置有实验桌、柜子、与标本制备区连通的传递窗和椅子，在实验桌上放置有实验仪器设备（包括定量PCR扩增仪、电脑、打印机、废液缸和垃圾筒等）。
前面设置有专用走廊，走廊的一侧是各实验区的缓冲区。三间实验区的布置依次为试剂准备区，标本制备区以及PCR扩增区。
（二）标准PCR实验室各工作区之间注意事项
（1）各工作区必须有明确的标记，避免不同工作区域内的设备、物品滥用。
（2）进入各工作区域必须严格按照单一方向进行，即：试剂准备区→标本制备区→PCR扩增区→产物分析区
（3）不同的工作区域使用不同的工作服，工作人员离开各工作区域时，不得将工作服带出。
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