医院PCR实验室建设过程中不可忽略的净化空调系统问题，在施工过程中出了要注意水电问题、还需要重视的是净化空调系统，实验室里控制进出实验室的人员。与实验无关的人员不得随意进出实验室，要设置独立的通道和进出整个实验区的门。
1.实验室空调通风系统设计及压力控制
PCR实验室并没有严格的净化要求，但是为避免各个实验区域间交叉污染的可能性，宜采用全送全排的气流组织形式。同时，要严格控制送、排风的比例以保证各实验区的压力要求。
2.污染的预防与控制
PCR实验室设计的核心问题是如何避免污染。在实际工作中，常见的有以下几种污染类型:扩增产物的污染；天然基音组的污染；试剂的污染以及标本间的污染。由于一旦发生污染，实验就必须停止，直到找到污染源为止，而且实验结果必须作废，需重新进行实验。所以发生污染后再围绕实验室来寻找污染源不但耗时而且繁琐，浪费人力物力。因此要避免污染，应是预防，而不是排除。
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